Exemplos de load_traj em Python

Exemplo n.º 1

Arquivo: test_rmsd.py Projeto: kyleabeauchamp/msmbuilder-legacy

    def setup(self):
        self.traj = load_traj()
        self.n_frames = self.traj["XYZList"].shape[0]
        self.n_atoms = self.traj["XYZList"].shape[1]

        # RMSD from frame 0 to other frames
        self.target = np.array([0, 0, 0.63297522])

Exemplo n.º 2

Arquivo: test_rmsd.py Projeto: lilipeng/msmbuilder

 def setup(self):
     self.traj = load_traj()
     self.n_frames = self.traj.n_frames
     self.n_atoms = self.traj.n_atoms
     
     # RMSD from frame 0 to other frames
     self.target = np.array([0,0,0.63297522])

Exemplo n.º 3

Arquivo: test_rmsd.py Projeto: jimsnyderjr/msmbuilder

    def setup(self):
        self.traj = load_traj()
        self.n_frames = self.traj['XYZList'].shape[0]
        self.n_atoms = self.traj['XYZList'].shape[1]

        # RMSD from frame 0 to other frames
        self.target = np.array([0, 0, 0.63297522])

Exemplo n.º 4

Arquivo: test_rmsd.py Projeto: autodataming/msmbuilder-legacy

 def setup(self):
     self.traj = load_traj()
     self.n_frames = self.traj.n_frames
     self.n_atoms = self.traj.n_atoms
     
     # RMSD from frame 0 to other frames
     self.target = np.array([0,0,0.63297522])

Exemplo n.º 5

Arquivo: test_dihedral.py Projeto: chrismichel/msmbuilder

 def setUp(self):
     self.traj = load_traj()
     self.n_frames = self.traj['XYZList'].shape[0]
     self.n_atoms = self.traj['XYZList'].shape[1]

Exemplo n.º 6

Arquivo: test_contact.py Projeto: jimsnyderjr/msmbuilder

 def setUp(self):
     self.traj = load_traj()
     self.n_frames = self.traj['XYZList'].shape[0]
     self.n_atoms = self.traj['XYZList'].shape[1]