Exemplos de Genome.mirror em Python

Exemplo n.º 1

Arquivo: test_db.py Projeto: yarden/cruzdb

    def test_mirror(self):

        try:
            os.unlink('/tmp/__u.db')
        except OSError:
            pass
        g = Genome('hg18')
        g.mirror(['chromInfo'], 'sqlite:////tmp/__u.db')
        a = str(g.chromInfo.filter().first())

        gs = Genome('sqlite:////tmp/__u.db')

        b = str(gs.chromInfo.filter().first())
        self.assertEqual(a, b)
        os.unlink('/tmp/__u.db')

Exemplo n.º 2

Arquivo: test_db.py Projeto: lbeltrame/cruzdb

    def test_mirror(self):

        try:
            os.unlink('/tmp/__u.db')
        except OSError:
            pass
        g = Genome('hg18')
        g.mirror(['chromInfo'], 'sqlite:////tmp/__u.db')
        a = str(g.chromInfo.filter().first())

        gs = Genome('sqlite:////tmp/__u.db')

        b = str(gs.chromInfo.filter().first())
        self.assertEqual(a, b)
        os.unlink('/tmp/__u.db')