def test_annotate(self):
schema = hl.tstruct(a=hl.tint32, b=hl.tint32, c=hl.tint32, d=hl.tint32, e=hl.tstr, f=hl.tarray(hl.tint32))
rows = [{'a': 4, 'b': 1, 'c': 3, 'd': 5, 'e': "hello", 'f': [1, 2, 3]},
{'a': 0, 'b': 5, 'c': 13, 'd': -1, 'e': "cat", 'f': []},
{'a': 4, 'b': 2, 'c': 20, 'd': 3, 'e': "dog", 'f': [5, 6, 7]}]
kt = hl.Table.parallelize(rows, schema)
self.assertTrue(kt.annotate()._same(kt))
result1 = convert_struct_to_dict(kt.annotate(foo=kt.a + 1,
foo2=kt.a).take(1)[0])
self.assertDictEqual(result1, {'a': 4,
'b': 1,
'c': 3,
'd': 5,
'e': "hello",
'f': [1, 2, 3],
'foo': 5,
'foo2': 4})
result3 = convert_struct_to_dict(kt.annotate(
x1=kt.f.map(lambda x: x * 2),
x2=kt.f.map(lambda x: [x, x + 1]).flatmap(lambda x: x),
x3=hl.min(kt.f),
x4=hl.max(kt.f),
x5=hl.sum(kt.f),
x6=hl.product(kt.f),
x7=kt.f.length(),
x8=kt.f.filter(lambda x: x == 3),
x9=kt.f[1:],
x10=kt.f[:],
x11=kt.f[1:2],
x12=kt.f.map(lambda x: [x, x + 1]),
x13=kt.f.map(lambda x: [[x, x + 1], [x + 2]]).flatmap(lambda x: x),
x14=hl.cond(kt.a < kt.b, kt.c, hl.null(hl.tint32)),
x15={1, 2, 3}
).take(1)[0])
self.assertDictEqual(result3, {'a': 4,
'b': 1,
'c': 3,
'd': 5,
'e': "hello",
'f': [1, 2, 3],
'x1': [2, 4, 6], 'x2': [1, 2, 2, 3, 3, 4],
'x3': 1, 'x4': 3, 'x5': 6, 'x6': 6, 'x7': 3, 'x8': [3],
'x9': [2, 3], 'x10': [1, 2, 3], 'x11': [2],
'x12': [[1, 2], [2, 3], [3, 4]],
'x13': [[1, 2], [3], [2, 3], [4], [3, 4], [5]],
'x14': None, 'x15': set([1, 2, 3])})
kt.annotate(
x1=kt.a + 5,
x2=5 + kt.a,
x3=kt.a + kt.b,
x4=kt.a - 5,
x5=5 - kt.a,
x6=kt.a - kt.b,
x7=kt.a * 5,
x8=5 * kt.a,
x9=kt.a * kt.b,
x10=kt.a / 5,
x11=5 / kt.a,
x12=kt.a / kt.b,
x13=-kt.a,
x14=+kt.a,
x15=kt.a == kt.b,
x16=kt.a == 5,
x17=5 == kt.a,
x18=kt.a != kt.b,
x19=kt.a != 5,
x20=5 != kt.a,
x21=kt.a > kt.b,
x22=kt.a > 5,
x23=5 > kt.a,
x24=kt.a >= kt.b,
x25=kt.a >= 5,
x26=5 >= kt.a,
x27=kt.a < kt.b,
x28=kt.a < 5,
x29=5 < kt.a,
x30=kt.a <= kt.b,
x31=kt.a <= 5,
x32=5 <= kt.a,
x33=(kt.a == 0) & (kt.b == 5),
x34=(kt.a == 0) | (kt.b == 5),
x35=False,
x36=True
)
def test_annotate(self):
schema = hl.tstruct(a=hl.tint32, b=hl.tint32, c=hl.tint32, d=hl.tint32, e=hl.tstr, f=hl.tarray(hl.tint32))
rows = [{'a': 4, 'b': 1, 'c': 3, 'd': 5, 'e': "hello", 'f': [1, 2, 3]},
{'a': 0, 'b': 5, 'c': 13, 'd': -1, 'e': "cat", 'f': []},
{'a': 4, 'b': 2, 'c': 20, 'd': 3, 'e': "dog", 'f': [5, 6, 7]}]
kt = hl.Table.parallelize(rows, schema)
self.assertTrue(kt.annotate()._same(kt))
result1 = convert_struct_to_dict(kt.annotate(foo=kt.a + 1,
foo2=kt.a).take(1)[0])
self.assertDictEqual(result1, {'a': 4,
'b': 1,
'c': 3,
'd': 5,
'e': "hello",
'f': [1, 2, 3],
'foo': 5,
'foo2': 4})
result3 = convert_struct_to_dict(kt.annotate(
x1=kt.f.map(lambda x: x * 2),
x2=kt.f.map(lambda x: [x, x + 1]).flatmap(lambda x: x),
x3=hl.min(kt.f),
x4=hl.max(kt.f),
x5=hl.sum(kt.f),
x6=hl.product(kt.f),
x7=kt.f.length(),
x8=kt.f.filter(lambda x: x == 3),
x9=kt.f[1:],
x10=kt.f[:],
x11=kt.f[1:2],
x12=kt.f.map(lambda x: [x, x + 1]),
x13=kt.f.map(lambda x: [[x, x + 1], [x + 2]]).flatmap(lambda x: x),
x14=hl.cond(kt.a < kt.b, kt.c, hl.null(hl.tint32)),
x15={1, 2, 3}
).take(1)[0])
self.assertDictEqual(result3, {'a': 4,
'b': 1,
'c': 3,
'd': 5,
'e': "hello",
'f': [1, 2, 3],
'x1': [2, 4, 6], 'x2': [1, 2, 2, 3, 3, 4],
'x3': 1, 'x4': 3, 'x5': 6, 'x6': 6, 'x7': 3, 'x8': [3],
'x9': [2, 3], 'x10': [1, 2, 3], 'x11': [2],
'x12': [[1, 2], [2, 3], [3, 4]],
'x13': [[1, 2], [3], [2, 3], [4], [3, 4], [5]],
'x14': None, 'x15': set([1, 2, 3])})
kt.annotate(
x1=kt.a + 5,
x2=5 + kt.a,
x3=kt.a + kt.b,
x4=kt.a - 5,
x5=5 - kt.a,
x6=kt.a - kt.b,
x7=kt.a * 5,
x8=5 * kt.a,
x9=kt.a * kt.b,
x10=kt.a / 5,
x11=5 / kt.a,
x12=kt.a / kt.b,
x13=-kt.a,
x14=+kt.a,
x15=kt.a == kt.b,
x16=kt.a == 5,
x17=5 == kt.a,
x18=kt.a != kt.b,
x19=kt.a != 5,
x20=5 != kt.a,
x21=kt.a > kt.b,
x22=kt.a > 5,
x23=5 > kt.a,
x24=kt.a >= kt.b,
x25=kt.a >= 5,
x26=5 >= kt.a,
x27=kt.a < kt.b,
x28=kt.a < 5,
x29=5 < kt.a,
x30=kt.a <= kt.b,
x31=kt.a <= 5,
x32=5 <= kt.a,
x33=(kt.a == 0) & (kt.b == 5),
x34=(kt.a == 0) | (kt.b == 5),
x35=False,
x36=True
)
