Exemplos de read_gsd em Python

Exemplo n.º 1

 def run_test_3(self, name, dim):
     filename = "{}.gsd".format(name)
     mc_cls = hoomd.hpmc.integrate.__dict__[name]
     self.system = init.read_gsd(filename=filename, frame=2)
     self.mc = mc_cls(seed=2398, d=0.0, restore_state=True)
     # self.mc.restore_state();
     self.gsd = None

Exemplo n.º 2

Arquivo: hpmc_gsd_state.py Projeto: joaander/hoomd-blue

 def run_test_3(self, name, dim):
     filename = "{}.gsd".format(name)
     mc_cls = hoomd.hpmc.integrate.__dict__[name]
     self.system = init.read_gsd(filename=filename, frame = 2);
     self.mc = mc_cls(seed=2398, d=0.0, restore_state=True)
     # self.mc.restore_state();
     self.gsd = None;

Exemplo n.º 3

 def run_test_2(self, name, dim):
     filename = "{}.gsd".format(name)
     mc_cls = hoomd.hpmc.integrate.__dict__[name]
     self.system = init.read_gsd(filename=filename, frame=9)
     self.mc = mc_cls(seed=2398, d=0.0)
     self.mc.shape_param.set('A', **self.params[name]['first'])
     self.mc.restore_state()
     self.gsd = None

Exemplo n.º 4

Arquivo: hpmc_gsd_state.py Projeto: joaander/hoomd-blue

 def run_test_2(self, name, dim):
     filename = "{}.gsd".format(name)
     mc_cls = hoomd.hpmc.integrate.__dict__[name]
     self.system = init.read_gsd(filename=filename, frame = 9);
     self.mc = mc_cls(seed=2398, d=0.0)
     self.mc.shape_param.set('A', **self.params[name]['first'])
     self.mc.restore_state();
     self.gsd = None;