Exemplos de save_model em Python

Exemplo n.º 1

Arquivo: test_pysb_assembler.py Projeto: bioinfonerd-forks/indra-1

def test_print_model():
    st = Phosphorylation(Agent('MAP2K1'), Agent('MAPK3'))
    pa = PysbAssembler([st])
    pa.make_model()
    pa.save_model('/dev/null')

Exemplo n.º 2

Arquivo: test_pysb_assembler.py Projeto: johnbachman/indra

def test_print_model():
    st = Phosphorylation(Agent('MAP2K1'), Agent('MAPK3'))
    pa = PysbAssembler([st])
    pa.make_model()
    pa.save_model('/dev/null')

Exemplo n.º 3

Arquivo: test_pysb_assembler.py Projeto: bioinfonerd-forks/indra-1

def test_increaseamount_hill():
    stmt = IncreaseAmount(Agent('TP53'), Agent('MDM2'))
    pa = PysbAssembler([stmt])
    pa.make_model(policies='hill')
    pa.save_model()
    assert len(pa.model.parameters) == 5

Exemplo n.º 4

Arquivo: test_pysb_assembler.py Projeto: johnbachman/indra

def test_increaseamount_hill():
    stmt = IncreaseAmount(Agent('TP53'), Agent('MDM2'))
    pa = PysbAssembler([stmt])
    pa.make_model(policies='hill')
    pa.save_model()
    assert len(pa.model.parameters) == 5