Exemplos de process_n em Python

Exemplo n.º 1

Arquivo: test_munge_sumstats.py Projeto: zhanyq/mtag

 def test_n_cas_con_flag(self):
     self.args.N = None
     self.args.N_cas = 1000.0
     self.args.N_con = 234.0
     dat = munge.process_n(self.dat, self.args, log)
     assert_series_equal(dat.N, self.N_const, check_names=False)

Exemplo n.º 2

Arquivo: test_munge_sumstats.py Projeto: zhanyq/mtag

 def test_nstudy(self):
     # should filter on NSTUDY if the --N flag is set, but N gets set to
     # 9999
     self.dat['NSTUDY'] = self.N
     dat = munge.process_n(self.dat, self.args, log)
     assert_frame_equal(dat, self.dat_filtered9999)

Exemplo n.º 3

Arquivo: test_munge_sumstats.py Projeto: zhanyq/mtag

 def test_n_cas_con_col(self):
     self.dat['N_CAS'] = self.N
     self.dat['N_CON'] = [0.0, 0, 0]
     dat = munge.process_n(self.dat, self.args, log)
     assert_frame_equal(dat, self.dat_filtered)

Exemplo n.º 4

Arquivo: test_munge_sumstats.py Projeto: Chris1221/ldsc

 def test_n_cas_con_flag(self):
     self.args.N = None
     self.args.N_cas = 1000.0
     self.args.N_con = 234.0
     dat = munge.process_n(self.dat, self.args, log)
     assert_series_equal(dat.N, self.N_const, check_names=False)

Exemplo n.º 5

Arquivo: test_munge_sumstats.py Projeto: zhanyq/mtag

 def test_n_col(self):
     self.dat['N'] = self.N
     dat = munge.process_n(self.dat, self.args, log)
     print dat
     print self.dat_filtered
     assert_frame_equal(dat, self.dat_filtered)

Exemplo n.º 6

Arquivo: test_munge_sumstats.py Projeto: Chris1221/ldsc

 def test_n_cas_con_col(self):
     self.dat['N_CAS'] = self.N
     self.dat['N_CON'] = [0.0, 0, 0]
     dat = munge.process_n(self.dat, self.args, log)
     assert_frame_equal(dat, self.dat_filtered)

Exemplo n.º 7

Arquivo: test_munge_sumstats.py Projeto: Chris1221/ldsc

 def test_nstudy(self):
     # should filter on NSTUDY if the --N flag is set, but N gets set to
     # 9999
     self.dat['NSTUDY'] = self.N
     dat = munge.process_n(self.dat, self.args, log)
     assert_frame_equal(dat, self.dat_filtered9999)

Exemplo n.º 8

Arquivo: test_munge_sumstats.py Projeto: Chris1221/ldsc

 def test_n_col(self):
     self.dat['N'] = self.N
     dat = munge.process_n(self.dat, self.args, log)
     print dat
     print self.dat_filtered
     assert_frame_equal(dat, self.dat_filtered)

Exemplo n.º 9

Arquivo: test_munge_sumstats.py Projeto: TanishaSH/ldsc

 def test_n_flag(self):
     self.args.N = 1234.0
     self.args.N_cas = None
     self.args.N_con = None
     dat = munge.process_n(self.dat, self.args, log)
     self.assertTrue(set(dat.N) == set(self.N_const))

Exemplo n.º 10

Arquivo: test_munge_sumstats.py Projeto: prabindm/ldsc

 def test_n_flag(self):
     self.args.N = 1234.0
     self.args.N_cas = None
     self.args.N_con = None
     dat = munge.process_n(self.dat, self.args, log)
     assert_series_equal(dat.N, self.N_const)