Exemplos de GafParser._validate_ontology_class_id em Python

Exemplo n.º 1

Arquivo: test_gafparser.py Projeto: cbp44/ontobio

def test_no_flag_valid_id():
    ont = OntologyFactory().create(ONT)
    p = GafParser()
    p.config.ontology = ont
    p._validate_ontology_class_id(
        "GO:0000785", assocparser.SplitLine("fake", [""] * 17, taxon="foo"))
    assert len(p.report.messages) == 0

Exemplo n.º 2

Arquivo: test_gafparser.py Projeto: lpalbou/ontobio

def test_no_flag_valid_id():
    ont = OntologyFactory().create(ONT)
    p = GafParser()
    p.config.ontology = ont
    p._validate_ontology_class_id("GO:0016070", "fake")
    assert len(p.report.messages) == 0