Exemplos de MSA.exclude em Python

Exemplo n.º 1

Arquivo: msa_test.py Projeto: MikkelSchubert/paleomix

def test_msa_exclude__remove_one():
    fa_1 = FASTA("A", None, "ACGT")
    fa_2 = FASTA("B", None, "GCTA")
    initial = MSA([fa_1, fa_2])
    expected = MSA([fa_1])
    result = initial.exclude(["B"])
    assert_equal(result, expected)

Exemplo n.º 2

Arquivo: msa_test.py Projeto: jelber2/paleomix

def test_msa_exclude__remove_one():
    fa_1 = FASTA("A", None, "ACGT")
    fa_2 = FASTA("B", None, "GCTA")
    initial = MSA([fa_1, fa_2])
    expected = MSA([fa_1])
    result = initial.exclude(["B"])
    assert_equal(result, expected)

Exemplo n.º 3

def test_msa_exclude__missing_keys():
    msa = MSA([FASTA("Foo", None, "ACGT")])
    with pytest.raises(KeyError):
        msa.exclude(["Bar"])

Exemplo n.º 4

def test_msa_exclude__no_keys():
    msa = MSA([FASTA("Foo", None, "ACGT")])
    with pytest.raises(ValueError):
        msa.exclude([])