Exemplos de Tree em Python

Exemplo n.º 1

 def test_empty_init(self):
     Tree()

Exemplo n.º 2

 def test_root(self):
     tree = Tree.from_newick(self.newick)
     deep_node = tree.loc['a']
     assert deep_node.root == tree

Exemplo n.º 3

 def test_input_output(self):
     tree = Tree.from_newick(self.newick)
     assert self.newick == tree.to_newick(branch_lengths=False)

Exemplo n.º 4

 def test_parsing(self):
     Tree.from_newick(self.newick)

Exemplo n.º 5

Arquivo: tree_tests.py Projeto: holmrenser/picea

 def test_root(self):
     tree = Tree.from_newick(self.newick)
     deep_node = tree.loc['a']
     self.assertEqual(deep_node.root, tree)

Exemplo n.º 6

Arquivo: tree_tests.py Projeto: holmrenser/picea

 def test_input_output(self):
     tree = Tree.from_newick(self.newick)
     self.assertEqual(self.newick, tree.to_newick(branch_lengths=False))