def test_encode_decode_pic(self):
"""
"""
encoded_array = pynumpress.encode_pic(
np.asarray(self.i_slof_data, dtype=np.float64))
decoded_array = pynumpress.decode_pic(encoded_array)
self.assertCountEqual(self.i_slof_data, decoded_array)
def test_numpress_pic(self):
data = mzml_spectra[0]['intensity array']
encoded = base64.b64encode(
pynumpress.encode_pic(data).tobytes()).decode('ascii')
record = aux.BinaryDataArrayTransformer()._make_record(
encoded, 'MS-Numpress positive integer compression', data.dtype)
self.assertTrue(np.allclose(data, record.decode(), atol=0.6))
def test_encode_pic_i_data(self):
encoded_array = pynumpress.encode_pic(np.asarray(self.i_data, dtype=np.float64))
self.assertEqual(
len(encoded_array),
14,
msg='{}'.format(
[hex(x) for x in encoded_array]
)
)
self.assertEqual(encoded_array[0], 0x20)
self.assertEqual(encoded_array[1], 0x4b)
self.assertEqual(encoded_array[2], 0x4c)
self.assertEqual(encoded_array[3], 0x43)
self.assertEqual(encoded_array[4], 0x1)
self.assertEqual(encoded_array[5], 0xbe)
self.assertEqual(encoded_array[6], 0x92)
self.assertEqual(encoded_array[7], 0x8)
self.assertEqual(encoded_array[8], 0x48)
self.assertEqual(encoded_array[9], 0xe1)
self.assertEqual(encoded_array[10], 0x20)
self.assertEqual(encoded_array[11], 0xb)
self.assertEqual(encoded_array[12], 0x17)
self.assertEqual(encoded_array[13], 0xb0)
def test_encode_decode_pic(self):
"""
"""
encoded_array = pynumpress.encode_pic(
np.asarray(self.i_slof_data, dtype=np.float64)
)
decoded_array = pynumpress.decode_pic(encoded_array)
self.assertCountEqual(self.i_slof_data, decoded_array)