def test_transcribe_preserves_all_metadata(self):
im = IntervalMetadata(4)
im.add([(0, 2)], metadata={'gene': 'p53'})
exp = RNA('AGUU', metadata={'foo': 'bar'},
positional_metadata={'foo': range(4)},
interval_metadata=im)
seq = DNA('AGTT', metadata={'foo': 'bar'},
positional_metadata={'foo': range(4)},
interval_metadata=im)
self.assertEqual(seq.transcribe(), exp)
def test_transcribe_does_not_modify_input(self):
seq = DNA('ATAT')
self.assertEqual(seq.transcribe(), RNA('AUAU'))
self.assertEqual(seq, DNA('ATAT'))
def test_transcribe_preserves_all_metadata(self):
exp = RNA('AGUU', metadata={'foo': 'bar'},
positional_metadata={'foo': range(4)})
seq = DNA('AGTT', metadata={'foo': 'bar'},
positional_metadata={'foo': range(4)})
self.assertEqual(seq.transcribe(), exp)
