def onTextEnter(self, event):
"""
Metodo que se ejecuta cuando se acciona la tecla "return" en el widget entry
"""
self.busqueda = Esearch(term=self.varBusqueda.get(), retmax=5)
for (idx, element) in enumerate(self.busqueda.ids_list):
cita = '{}. {}\n'.format(idx + 1, Esummary(element).vancouverCyte)
self.lstArticle.insert(END, cita)
def fntSearch(event):
"""
Inserta los articulos encontrados en la busqueda en la listbox en formato con las reglas de Vancouver
"""
busqueda = Esearch(term=stringsearch.get(), retmax=30)
pos = 0
for (idx, element) in enumerate(busqueda.ids_list):
cita = '{}. {}'.format(idx + 1, Esummary(element).vancouverCyte)
lista.insert(pos, cita)
pos += 1
#!/bin/python
"""Effectue une recherche de la chaîne passée en paramètre."""
import sys
from esearch import Esearch
ES = Esearch("localhost", 9200)
print(ES.search("base", sys.argv[1]))
Utiliza la funcion efetch de la API eutility para obtener el abastract del articulo
"""
def __init__(self, pmid, db='pubmed'):
self.pmid = pmid
self.db = db
base = 'https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi?'
params = dict(id=self.pmid, db=self.db, retmode='xml')
response = requests.get(base, params).content
soup = BeautifulSoup(response, 'lxml')
#self.abstract = soup.find('abstracttext')
abstracttext_soup = soup.find_all('abstracttext')
abstracttext = [element.get_text() for element in abstracttext_soup ]
self.abstract = '.'.join(abstracttext)
def __str__(self):
"""
Sobreescribe la funcion especial '__str__()' para utilizar la funcion 'print'
"""
return self.abstract.get_text()
if __name__ == '__main__':
busqueda = input('Busqueda: ')
b = Esearch(term=busqueda)
ids = b.ids_list
abstr = Efetch(ids[1]).abstract
print(abstr)
"""Importation d'un fichier depuis la ligne de commande.
Utilisation : python indexation_auto.py <fichier> <index>
"""
import sys
from esearch import Esearch
ES = Esearch("localhost", 9200)
ES.create_index(sys.argv[2])
ES.index_file(sys.argv[1], sys.argv[2], log=True)
"""Permet de supprimer l'index passe en parametre."""
import sys
from esearch import Esearch
ES = Esearch("localhost", 9200)
ES.delete_index(sys.argv[1])