Python _softclip примеры использования

Пример #1

 def test_softclip_replacesConsumingOpsWithSoftClips(self):
     util = cigar.CigarUtil(0, "1M")
     self.assertEquals("HS"
                       "SSSS"
                       "SH", util._softclip(cigar_profile="HS"
                                            "MI=X"
                                            "SH"))

Пример #2

Файл: cigar_test.py Проект: umich-brcf-bioinf/Katana

 def test_softclip_replacesConsumingOpsWithSoftClips(self):
     util = cigar.CigarUtil(0, "1M")
     self.assertEquals("HS" "SSSS" "SH",
                       util._softclip(cigar_profile="HS" "MI=X" "SH"))

Пример #3

 def test_softclip_removesNonConsumingOps(self):
     util = cigar.CigarUtil(0, "1M")
     self.assertEquals("HS"
                       "SH", util._softclip(cigar_profile="HS"
                                            "DP"
                                            "SH"))

Пример #4

Файл: cigar_test.py Проект: umich-brcf-bioinf/Katana

 def test_softclip_removesNonConsumingOps(self):
     util = cigar.CigarUtil(0, "1M")
     self.assertEquals("HS" "SH",
                       util._softclip(cigar_profile="HS" "DP" "SH"))