def test_EPIDeWarp_inputs():
input_map = dict(ignore_exception=dict(nohash=True,
usedefault=True,
),
exf_file=dict(argstr='--exf %s',
),
dph_file=dict(mandatory=True,
argstr='--dph %s',
),
esp=dict(usedefault=True,
argstr='--esp %s',
),
mag_file=dict(position=0,
mandatory=True,
argstr='--mag %s',
),
nocleanup=dict(usedefault=True,
argstr='--nocleanup',
),
args=dict(argstr='%s',
),
epi_file=dict(argstr='--epi %s',
),
tmpdir=dict(argstr='--tmpdir %s',
genfile=True,
),
terminal_output=dict(mandatory=True,
nohash=True,
),
environ=dict(nohash=True,
usedefault=True,
),
exfdw=dict(argstr='--exfdw %s',
genfile=True,
),
output_type=dict(),
cleanup=dict(argstr='--cleanup',
),
epidw=dict(argstr='--epidw %s',
genfile=False,
),
sigma=dict(argstr='--sigma %s',
usedefault=True,
),
vsm=dict(argstr='--vsm %s',
genfile=True,
),
tediff=dict(usedefault=True,
argstr='--tediff %s',
),
)
inputs = EPIDeWarp.input_spec()
for key, metadata in input_map.items():
for metakey, value in metadata.items():
yield assert_equal, getattr(inputs.traits()[key], metakey), value
def test_EPIDeWarp_outputs():
output_map = dict(unwarped_file=dict(),
vsm_file=dict(),
exfdw=dict(),
exf_mask=dict(),
)
outputs = EPIDeWarp.output_spec()
for key, metadata in output_map.items():
for metakey, value in metadata.items():
yield assert_equal, getattr(outputs.traits()[key], metakey), value
def test_EPIDeWarp_outputs():
output_map = dict(
exf_mask=dict(),
exfdw=dict(),
unwarped_file=dict(),
vsm_file=dict(),
)
outputs = EPIDeWarp.output_spec()
for key, metadata in output_map.items():
for metakey, value in metadata.items():
yield assert_equal, getattr(outputs.traits()[key], metakey), value
def test_EPIDeWarp_inputs():
input_map = dict(
args=dict(argstr='%s', ),
cleanup=dict(argstr='--cleanup', ),
dph_file=dict(
argstr='--dph %s',
mandatory=True,
),
environ=dict(
nohash=True,
usedefault=True,
),
epi_file=dict(argstr='--epi %s', ),
epidw=dict(
argstr='--epidw %s',
genfile=False,
),
esp=dict(
argstr='--esp %s',
usedefault=True,
),
exf_file=dict(argstr='--exf %s', ),
exfdw=dict(
argstr='--exfdw %s',
genfile=True,
),
ignore_exception=dict(
nohash=True,
usedefault=True,
),
mag_file=dict(
argstr='--mag %s',
mandatory=True,
position=0,
),
nocleanup=dict(
argstr='--nocleanup',
usedefault=True,
),
output_type=dict(),
sigma=dict(
argstr='--sigma %s',
usedefault=True,
),
tediff=dict(
argstr='--tediff %s',
usedefault=True,
),
terminal_output=dict(nohash=True, ),
tmpdir=dict(
argstr='--tmpdir %s',
genfile=True,
),
vsm=dict(
argstr='--vsm %s',
genfile=True,
),
)
inputs = EPIDeWarp.input_spec()
for key, metadata in input_map.items():
for metakey, value in metadata.items():
yield assert_equal, getattr(inputs.traits()[key], metakey), value
