Python _create_taxonomy_dic示例

示例#1

文件： test_hybridtree.py 项目： wasade/ghost-tree

 def test_create_taxonomy_dic_many(self):
     test = {'P1': 'k__Fungi;p__As;c__Do;o__My;f__Els;g__Phoma;s__El',
             'P2': 'k__Fungi;p__As;c__Do;o__My;f__Els;g__phoma;s__El',
             'C1': 'k__Fungi;p__As;c__Do;o__My;f__Els;g__Candida;s__El',
             'C2': 'k__Fungi;p__As;c__Do;o__My;f__Els;g__Candida;s__El',
             'C3': 'k__Fungi;p__As;c__Do;o__My;f__Els;g__Candida;s__El',
             'C4': 'k__Fungi;p__As;c__Do;o__My;f__Els;g__Candida;s__El',
             'C5': 'k__Fungi;p__As;c__Do;o__My;f__Els;g__Candida;s__El',
             'M1': 'k__Fungi;p__As;c__Do;o__My;f__Els;g__Mucor;s__El',
             'M2': 'k__Fungi;p__As;c__Do;o__My;f__Els;g__Mucor;s__El',
             'M3': 'k__Fungi;p__As;c__Do;o__My;f__Els;g__Mucor;s__El',
             'M4': 'k__Fungi;p__As;c__Do;o__My;f__Els;g__Mucor;s__El'}
     result = _create_taxonomy_dic(self.extension_taxonomy)
     self.assertDictEqual(result, test)

示例#2

文件： test_hybridtree.py 项目： johnchase/hybrid_tree

 def test_create_taxonomy_dic_many(self):
     test = {
         'P1': 'k__Fungi;p__As;c__Do;o__My;f__Els;g__Phoma;s__El',
         'P2': 'k__Fungi;p__As;c__Do;o__My;f__Els;g__phoma;s__El',
         'C1': 'k__Fungi;p__As;c__Do;o__My;f__Els;g__Candida;s__El',
         'C2': 'k__Fungi;p__As;c__Do;o__My;f__Els;g__Candida;s__El',
         'C3': 'k__Fungi;p__As;c__Do;o__My;f__Els;g__Candida;s__El',
         'C4': 'k__Fungi;p__As;c__Do;o__My;f__Els;g__Candida;s__El',
         'C5': 'k__Fungi;p__As;c__Do;o__My;f__Els;g__Candida;s__El',
         'M1': 'k__Fungi;p__As;c__Do;o__My;f__Els;g__Mucor;s__El',
         'M2': 'k__Fungi;p__As;c__Do;o__My;f__Els;g__Mucor;s__El',
         'M3': 'k__Fungi;p__As;c__Do;o__My;f__Els;g__Mucor;s__El',
         'M4': 'k__Fungi;p__As;c__Do;o__My;f__Els;g__Mucor;s__El'
     }
     result = _create_taxonomy_dic(self.extension_taxonomy)
     self.assertDictEqual(result, test)

示例#3

文件： test_hybridtree.py 项目： wasade/ghost-tree

 def test_create_taxonomy_dic_none(self):
     with self.assertRaises(ValueError):
         list(_create_taxonomy_dic(self.extension_taxonomy_none))

示例#4

文件： test_hybridtree.py 项目： johnchase/hybrid_tree

 def test_create_taxonomy_dic_none(self):
     with self.assertRaises(ValueError):
         list(_create_taxonomy_dic(self.extension_taxonomy_none))