Python pairs示例

示例#1

def run_pairs(infile=None, outfile=None):
    from jcvi.assembly.allpaths import pairs
    pairs(infile)

示例#2

文件： preprocess.py 项目： Nicholas-NVS/jcvi

def run_pairs(infile=None, outfile=None, suffix=False):
    from jcvi.assembly.allpaths import pairs
    args = infile
    if suffix:
        args.append("--suffix")
    pairs(args)

示例#3

def run_pairs(infile=None, outfile=None, suffix=False):
    from jcvi.assembly.allpaths import pairs
    args = infile
    if suffix:
        args.append("--suffix")
    pairs(args)