(bitscore,length,orfQid,orfSid) = uqkey
dpcpacbpcol.add_edge(nodeQ,nodeS,wt=bitscore)
############################################################################
if verbose:
print pacbpcol, "bitscores:",
print [ pacbporf.bitscore for pacbporf in dpcpacbpcol.pacbps.values() ]
############################################################################
# do some transformations on the pacbpcol
pacbpcol.remove_low_connectivity_nodes(min_connectivity=cbg.node_count()-1)
splittedCBGs = pacbpcol.find_fully_connected_subgraphs(
edges=cbg.node_count()-1 , max_missing_edges=0 )
# convert to list of CBGs and do some transformations
cbgList = ListOfCodingBlockGraphs(splittedCBGs,input={},crossdata={})
cbgList.remove_all_but_cbgs()
cbgList.remove_cbgs_with_lt_nodes(cbg.node_count())
cbgList.harvest_pacbps_from_pacbpcollection(dpcpacbpcol)
cbgList.remove_cbgs_without_omsr()
cbgList.update_edge_weights_by_minimal_spanning_range()
cbgList.order_graphlist_by_total_weight_and_identity()
############################################################################
if verbose:
print "FScbgs (%s)" % len(cbgList)
for fscbg in cbgList: print fscbg
############################################################################
if not cbgList:
# no (better) frameshifted CBG
return None
