def main():
work_dir = []
if len(sys.argv) == 1:
work_dir = r'./data/dopIrO2_2'
elif len(sys.argv) == 2:
work_dir = sys.argv[1]
if not os.path.isdir(work_dir):
sys.exit()
###
finished_dirs = mW.check_printout(work_dir, 'ts')
multi_CM(finished_dirs)
def main():
work_dir = []
if len(sys.argv) == 1:
work_dir = r'./data/dopIrO2_2'
elif len(sys.argv) == 2:
work_dir = sys.argv[1]
if not os.path.isdir(work_dir):
sys.exit()
###
finished_dirs = mW.check_printout(work_dir, 'suf')
prepare_CH3ab(work_dir, finished_dirs)
def main():
if len(sys.argv) == 1:
work_dir = r'./data/dopRutile'
finished_dirs = mW.check_printout(work_dir, 'suf')
print(finished_dirs)
prepare_ab(work_dir, finished_dirs)
elif len(sys.argv) == 2:
work_dir = sys.argv[1]
finished_dirs = mW.check_printout(work_dir, 'suf')
prepare_ab(work_dir, finished_dirs)
elif len(sys.argv) == 3:
work_dir = sys.argv[1]
element = sys.argv[2]
finished_dirs = []
converg_dirs = mW.check_printout(work_dir, 'suf')
for vasp_dir in converg_dirs:
if re.match(r'.*' + element + r'O2_.*', vasp_dir):
finished_dirs.append(vasp_dir)
prepare_ab(work_dir, finished_dirs)
else:
print('Wrong argvs!')
sys.exit()
mC.create_VASPsp(dir, suf_dir, ts_dir)
mC.create_INCAR(dir, suf_dir, ts_dir, '1')
shutil.copyfile(os.path.join(suf_dir, 'KPOINTS'),
os.path.join(ts_dir, 'KPOINTS'))
create_POSCAR(dir, suf_dir, ts_dir)
mC.create_POTCAR(ts_dir, './potpaw_PBE.54')
create_fort188(dir, suf_dir, ts_dir)
else:
os.system(r'echo %s making ts >> %s' % (ts_dir, result_path))
os.mkdir(ts_dir)
mC.create_VASPsp(dir, suf_dir, ts_dir)
mC.create_INCAR(dir, suf_dir, ts_dir, '1')
shutil.copyfile(os.path.join(suf_dir, 'KPOINTS'),
os.path.join(ts_dir, 'KPOINTS'))
create_POSCAR(dir, suf_dir, ts_dir)
mC.create_POTCAR(ts_dir, './potpaw_PBE.54')
create_fort188(dir, suf_dir, ts_dir)
###
##
work_dir = []
if len(sys.argv) == 1:
work_dir = r'./data/dopIrO2_2'
elif len(sys.argv) == 2:
work_dir = sys.argv[1]
if not os.path.isdir(work_dir):
sys.exit()
finished_dirs = mW.check_printout(work_dir, 'suf')
prepare_ts(work_dir, finished_dirs)