def test_gen_gsm_html_with_already_existed_html(self, L): gse_dir = gen_csv.gen_gse_dir(self.temp_outdir, self.gse) gsm_html = os.path.join(gse_dir, '{0}.html'.format(self.gsm)) with open(gsm_html, 'wb') as opf: opf.write('') gen_csv.gen_gsm_html(self.temp_outdir, self.gse, self.gsm) L.check(('rsempipeline.preprocess.gen_csv', 'INFO', '{0} already downloaded'.format(gsm_html)))
def test_gen_gse_dir(self): html_dir = gen_csv.gen_html_outdir(self.temp_outdir) d = os.path.join(html_dir, self.gse) self.assertEqual(d, gen_csv.gen_gse_dir(self.temp_outdir, self.gse)) self.assertTrue(os.path.exists(d))