Python RNA.reverse_transcribe示例

示例#1

 def test_reverse_transcribe_preserves_all_metadata(self):
     seq = RNA('AGUU',
               metadata={'foo': 'bar'},
               positional_metadata={'foo': range(4)})
     exp = DNA('AGTT',
               metadata={'foo': 'bar'},
               positional_metadata={'foo': range(4)})
     self.assertEqual(seq.reverse_transcribe(), exp)

示例#2

文件： test_rna.py 项目： ElDeveloper/biolopy

    def test_reverse_transcribe_preserves_all_metadata(self):
        im = IntervalMetadata(4)
        im.add([(0, 2)], metadata={'gene': 'p53'})

        seq = RNA('AGUU', metadata={'foo': 'bar'},
                  positional_metadata={'foo': range(4)},
                  interval_metadata=im)
        exp = DNA('AGTT', metadata={'foo': 'bar'},
                  positional_metadata={'foo': range(4)},
                  interval_metadata=im)
        self.assertEqual(seq.reverse_transcribe(), exp)

示例#3

文件： test_rna.py 项目： zengqingsong/scikit-bio

    def test_reverse_transcribe_preserves_all_metadata(self):
        im = IntervalMetadata(4)
        im.add([(0, 2)], metadata={'gene': 'p53'})

        seq = RNA('AGUU', metadata={'foo': 'bar'},
                  positional_metadata={'foo': range(4)},
                  interval_metadata=im)
        exp = DNA('AGTT', metadata={'foo': 'bar'},
                  positional_metadata={'foo': range(4)},
                  interval_metadata=im)
        self.assertEqual(seq.reverse_transcribe(), exp)

示例#4

文件： test_rna.py 项目： anderspitman/scikit-bio

 def test_reverse_transcribe_does_not_modify_input(self):
     seq = RNA('AUAU')
     self.assertEqual(seq.reverse_transcribe(), DNA('ATAT'))
     self.assertEqual(seq, RNA('AUAU'))

示例#5

文件： test_rna.py 项目： anderspitman/scikit-bio

 def test_reverse_transcribe_preserves_all_metadata(self):
     seq = RNA('AGUU', metadata={'foo': 'bar'},
               positional_metadata={'foo': range(4)})
     exp = DNA('AGTT', metadata={'foo': 'bar'},
               positional_metadata={'foo': range(4)})
     self.assertEqual(seq.reverse_transcribe(), exp)

示例#6

文件： test_rna.py 项目： SantosJGND/Nlas

 def test_reverse_transcribe_does_not_modify_input(self):
     seq = RNA('AUAU')
     self.assertEqual(seq.reverse_transcribe(), DNA('ATAT'))
     self.assertEqual(seq, RNA('AUAU'))