Python compareMiRNANames示例

示例#1

文件： stats_test.py 项目： baliga-lab/sygnal

 def test_compare_a_is5p_mismatch(self):
     self.assertFalse(sygnal.compareMiRNANames('hsa-let-7fp-2-5p', 'hsa-let-7f'))

示例#2

文件： stats_test.py 项目： baliga-lab/sygnal

 def test_compare_a_is3p_mismatch(self):
     self.assertFalse(sygnal.compareMiRNANames('hsa-let-7f-3pp-1-3p', 'hsa-let-7f-3p'))

示例#3

文件： stats_test.py 项目： baliga-lab/sygnal

 def test_compare_a_is5p(self):
     self.assertTrue(sygnal.compareMiRNANames('hsa-let-7f-2-5p', 'hsa-let-7f'))
     self.assertTrue(sygnal.compareMiRNANames('hsa-let-7fa-2-5p', 'hsa-let-7f'))

示例#4

文件： stats_test.py 项目： baliga-lab/sygnal

 def test_compare_identical(self):
     self.assertTrue(sygnal.compareMiRNANames('miRNA', 'miRNA'))

示例#5

文件： stats_test.py 项目： baliga-lab/sygnal

 def test_compare_a_is3p(self):
     self.assertTrue(sygnal.compareMiRNANames('hsa-let-7f-3p-1-3p', 'hsa-let-7f-3p'))
     self.assertTrue(sygnal.compareMiRNANames('hsa-let-7f-3pb-1-3p', 'hsa-let-7f-3p'))

示例#6

 def test_compare_a_is5p_mismatch(self):
     self.assertFalse(
         sygnal.compareMiRNANames('hsa-let-7fp-2-5p', 'hsa-let-7f'))

示例#7

 def test_compare_a_is5p(self):
     self.assertTrue(
         sygnal.compareMiRNANames('hsa-let-7f-2-5p', 'hsa-let-7f'))
     self.assertTrue(
         sygnal.compareMiRNANames('hsa-let-7fa-2-5p', 'hsa-let-7f'))

示例#8

 def test_compare_a_is3p_mismatch(self):
     self.assertFalse(
         sygnal.compareMiRNANames('hsa-let-7f-3pp-1-3p', 'hsa-let-7f-3p'))

示例#9

 def test_compare_a_is3p(self):
     self.assertTrue(
         sygnal.compareMiRNANames('hsa-let-7f-3p-1-3p', 'hsa-let-7f-3p'))
     self.assertTrue(
         sygnal.compareMiRNANames('hsa-let-7f-3pb-1-3p', 'hsa-let-7f-3p'))

示例#10

 def test_compare_identical(self):
     self.assertTrue(sygnal.compareMiRNANames('miRNA', 'miRNA'))