Python irm示例

示例#1

    def setUp(self):
        self.obj_path = os.path.join(self.IRODS_HOME_PATH,
                                     self.POPULATE_FILE_NAME)

        irm('-rf', self.obj_path)
        iput(
            os.path.join(os.path.dirname(os.path.realpath(__file__)),
                         'samples', self.POPULATE_FILE_NAME))

示例#2

文件： test_extract_jpeg.py 项目： Metalnx/metalnx-msi

 def tearDown(self):
     irm('-rf', self.JPEG_OBJ_PATH)

示例#3

文件： test_extract_bam.py 项目： Metalnx/metalnx-msi

 def tearDown(self):
     irm('-rf', self.BAM_OBJ_PATH)

示例#4

文件： test_rule_deployment.py 项目： jsbanky/metalnx-msi

 def cleanUp(self):
     irm('-rf', self.rule_obj_path)  # remove file from iRODS
     _call('rm', '-rf', self.rule_file_path)  # remove file from local file system
     _call('rm', '-rf', join(self.IRODS_ETC_DIR, self.RULE_DEPLOYMENT_FILE_NAME))  # remove rule from /etc/irods

示例#5

文件： test_extract_vcf.py 项目： Metalnx/metalnx-msi

 def tearDown(self):
     irm('-rf', self.VCF_OBJ_PATH)

示例#6

 def tearDown(self):
     irm('-rf', self.obj_path)

示例#7

 def tearDown(self):
     irm('-rf', self.BAM_OBJ_PATH)

示例#8

 def tearDown(self):
     irm('-rf', self.JPEG_OBJ_PATH)

示例#9

文件： test_extract_vcf.py 项目： jsbanky/metalnx-msi

 def tearDown(self):
     irm('-rf', self.VCF_OBJ_PATH)

示例#10

文件： test_manifest.py 项目： Metalnx/metalnx-msi

    def setUp(self):
        self.obj_path = os.path.join(self.IRODS_HOME_PATH, self.MANIFEST_FILE_NAME)
        self.file_path = os.path.join(os.path.dirname(os.path.realpath(__file__)), 'samples', self.MANIFEST_FILE_NAME)

        irm('-rf', self.obj_path)
        iput(self.file_path)

示例#11

文件： test_manifest.py 项目： Metalnx/metalnx-msi

 def tearDown(self):
     irm('-rf', self.obj_path)

示例#12

 def tearDown(self):
     irm('-rf', self.ILLUMINA_OBJ_PATH)
     irm('-rf', self.ILLUMINA_FOLDER_PATH)

示例#13

文件： test_extract_illumina.py 项目： Metalnx/metalnx-msi

 def tearDown(self):
     irm('-rf', self.ILLUMINA_OBJ_PATH)
     irm('-rf', self.ILLUMINA_FOLDER_PATH)