Beispiel #1
0
def parser():
    parser = ArgumentParser(formatter_class=ArgumentDefaultsHelpFormatter)
    parser = curation_parser(parser)
    parser = cellfinder_parse.pixel_parser(parser)
    parser = cellfinder_parse.misc_parse(parser)
    parser = cellfinder_parse.cube_extract_parse(parser)
    return parser
Beispiel #2
0
def region_summary_cli_parser():
    parser = argparse.ArgumentParser(
        formatter_class=argparse.ArgumentDefaultsHelpFormatter)
    parser = cli_parse(parser)
    parser = cellfinder_parse.count_summary_parse(parser)
    parser = cellfinder_parse.pixel_parser(parser)
    return parser
def cells_standard_space_cli_parser():
    parser = ArgumentParser(formatter_class=ArgumentDefaultsHelpFormatter)
    parser = cli_parse(parser)
    parser = cellfinder_parse.pixel_parser(parser)
    parser = cellfinder_parse.standard_space_parse(parser)
    parser = cellfinder_parse.misc_parse(parser)

    return parser