Beispiel #1
0
 def test_odof(self):
     pipelines.anova_pipeline([
         self.prog, '--input-ic50', self.filename, '--drug',
         'Drug_1047_IC50', '--no-html', '--feature', 'TP53_mut'
     ])
     pipelines.anova_pipeline([
         self.prog, '--input-ic50', self.filename, '--drug',
         'Drug_1047_IC50', '--feature', 'TP53_mut'
     ])
Beispiel #2
0
 def test_odof(self):
     pipelines.anova_pipeline([self.prog, '--input-ic50', self.filename,
         '--drug', 'Drug_1047_IC50', '--no-html', '--feature', 'TP53_mut'])
     pipelines.anova_pipeline([self.prog, '--input-ic50', self.filename,
         '--drug', 'Drug_1047_IC50', '--feature', 'TP53_mut'])
Beispiel #3
0
 def test_odaf_fast(self):
     pipelines.anova_pipeline([self.prog, '--input-ic50', self.filename,
         '--drug', 'Drug_1047_IC50', '--no-html', '--fast'])
Beispiel #4
0
 def test_print_feature_names(self):
     pipelines.anova_pipeline([self.prog, '--input-ic50', self.filename,
         '--print-feature-names'])
Beispiel #5
0
 def test_print_drug_names(self):
     pipelines.anova_pipeline([self.prog, '--input-ic50', self.filename,
         '--print-drug-names'])
Beispiel #6
0
 def test_help(self):
     pipelines.anova_pipeline([self.prog, '--help'])
     pipelines.anova_pipeline([self.prog])
Beispiel #7
0
 def test_help(self):
     pipelines.anova_pipeline([self.prog, '--help'])
     pipelines.anova_pipeline([self.prog])
Beispiel #8
0
 def test_license(self):
     pipelines.anova_pipeline([self.prog, '--license'])
Beispiel #9
0
 def test_license(self):
     pipelines.anova_pipeline([self.prog, '--license'])
Beispiel #10
0
 def test_adaf(self):
     pipelines.anova_pipeline(
         [self.prog, '--input-ic50', self.filename, '--no-html'])
Beispiel #11
0
 def test_adof(self):
     pipelines.anova_pipeline([
         self.prog, '--input-ic50', self.filename, '--no-html', '--feature',
         'TP53_mut'
     ])
Beispiel #12
0
 def test_odaf_fast(self):
     pipelines.anova_pipeline([
         self.prog, '--input-ic50', self.filename, '--drug',
         'Drug_1047_IC50', '--no-html', '--fast'
     ])
Beispiel #13
0
 def test_print_feature_names(self):
     pipelines.anova_pipeline([
         self.prog, '--input-ic50', self.filename, '--print-feature-names'
     ])
Beispiel #14
0
 def test_print_drug_names(self):
     pipelines.anova_pipeline(
         [self.prog, '--input-ic50', self.filename, '--print-drug-names'])
Beispiel #15
0
 def test_adof(self):
     pipelines.anova_pipeline([self.prog, '--input-ic50', self.filename,
         '--no-html', '--feature', 'TP53_mut'])
Beispiel #16
0
 def test_summary(self):
     pipelines.anova_pipeline([self.prog, '--testing'])
Beispiel #17
0
 def test_adaf(self):
     pipelines.anova_pipeline([self.prog, '--input-ic50', self.filename,
         '--no-html'])
Beispiel #18
0
 def test_version(self):
     pipelines.anova_pipeline([self.prog, '--version'])
Beispiel #19
0
 def test_summary(self):
     pipelines.anova_pipeline([self.prog, '--testing'])
Beispiel #20
0
 def test_version(self):
     pipelines.anova_pipeline([self.prog, '--version'])