Esempio n. 1
0
 def test_odof(self):
     pipelines.anova_pipeline([
         self.prog, '--input-ic50', self.filename, '--drug',
         'Drug_1047_IC50', '--no-html', '--feature', 'TP53_mut'
     ])
     pipelines.anova_pipeline([
         self.prog, '--input-ic50', self.filename, '--drug',
         'Drug_1047_IC50', '--feature', 'TP53_mut'
     ])
Esempio n. 2
0
 def test_odof(self):
     pipelines.anova_pipeline([self.prog, '--input-ic50', self.filename,
         '--drug', 'Drug_1047_IC50', '--no-html', '--feature', 'TP53_mut'])
     pipelines.anova_pipeline([self.prog, '--input-ic50', self.filename,
         '--drug', 'Drug_1047_IC50', '--feature', 'TP53_mut'])
Esempio n. 3
0
 def test_odaf_fast(self):
     pipelines.anova_pipeline([self.prog, '--input-ic50', self.filename,
         '--drug', 'Drug_1047_IC50', '--no-html', '--fast'])
Esempio n. 4
0
 def test_print_feature_names(self):
     pipelines.anova_pipeline([self.prog, '--input-ic50', self.filename,
         '--print-feature-names'])
Esempio n. 5
0
 def test_print_drug_names(self):
     pipelines.anova_pipeline([self.prog, '--input-ic50', self.filename,
         '--print-drug-names'])
Esempio n. 6
0
 def test_help(self):
     pipelines.anova_pipeline([self.prog, '--help'])
     pipelines.anova_pipeline([self.prog])
Esempio n. 7
0
 def test_help(self):
     pipelines.anova_pipeline([self.prog, '--help'])
     pipelines.anova_pipeline([self.prog])
Esempio n. 8
0
 def test_license(self):
     pipelines.anova_pipeline([self.prog, '--license'])
Esempio n. 9
0
 def test_license(self):
     pipelines.anova_pipeline([self.prog, '--license'])
Esempio n. 10
0
 def test_adaf(self):
     pipelines.anova_pipeline(
         [self.prog, '--input-ic50', self.filename, '--no-html'])
Esempio n. 11
0
 def test_adof(self):
     pipelines.anova_pipeline([
         self.prog, '--input-ic50', self.filename, '--no-html', '--feature',
         'TP53_mut'
     ])
Esempio n. 12
0
 def test_odaf_fast(self):
     pipelines.anova_pipeline([
         self.prog, '--input-ic50', self.filename, '--drug',
         'Drug_1047_IC50', '--no-html', '--fast'
     ])
Esempio n. 13
0
 def test_print_feature_names(self):
     pipelines.anova_pipeline([
         self.prog, '--input-ic50', self.filename, '--print-feature-names'
     ])
Esempio n. 14
0
 def test_print_drug_names(self):
     pipelines.anova_pipeline(
         [self.prog, '--input-ic50', self.filename, '--print-drug-names'])
Esempio n. 15
0
 def test_adof(self):
     pipelines.anova_pipeline([self.prog, '--input-ic50', self.filename,
         '--no-html', '--feature', 'TP53_mut'])
Esempio n. 16
0
 def test_summary(self):
     pipelines.anova_pipeline([self.prog, '--testing'])
Esempio n. 17
0
 def test_adaf(self):
     pipelines.anova_pipeline([self.prog, '--input-ic50', self.filename,
         '--no-html'])
Esempio n. 18
0
 def test_version(self):
     pipelines.anova_pipeline([self.prog, '--version'])
Esempio n. 19
0
 def test_summary(self):
     pipelines.anova_pipeline([self.prog, '--testing'])
Esempio n. 20
0
 def test_version(self):
     pipelines.anova_pipeline([self.prog, '--version'])