Ejemplos de TermForTermEnrichmentFinder.TermForTermEnrichmentFinder en Python

Lenguaje de programación: Python

Namespace/Package Name: Bio.Ontology

Clase / Tipo: TermForTermEnrichmentFinder

Método / Función: TermForTermEnrichmentFinder

Ejemplos en hotexamples.com: 2

Python TermForTermEnrichmentFinder.TermForTermEnrichmentFinder - 2 ejemplos encontrados. Estos son los ejemplos en Python del mundo real mejor valorados de Bio.Ontology.TermForTermEnrichmentFinder.TermForTermEnrichmentFinder extraídos de proyectos de código abierto. Puedes valorar ejemplos para ayudarnos a mejorar la calidad de los ejemplos.

Métodos usados con frecuencia

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TermForTermEnrichmentFinder(2)

find_enrichment(2)

_find_terms_associations(1)

Ejemplo n.º 1

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Archivo: test_Ontology.py Proyecto: umath92/biopython

 def setUp(self):
     self.go_graph = OntoIO.read("Ontology/go_test.obo", "obo")
     self.assocs = OntoIO.read("Ontology/ga_test.fb", "gaf")
     self.ef = TermForTermEnrichmentFinder(self.assocs, self.go_graph)

Ejemplo n.º 2

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Archivo: run_enrichment.py Proyecto: szymczakpau/biopython

def run_term(assocs, go_graph, gene_list, corrections):
    from Bio.Ontology import TermForTermEnrichmentFinder

    ef = TermForTermEnrichmentFinder(assocs, go_graph)
    result = ef.find_enrichment(gene_list, corrections)
    return result