Ejemplos de PipelineReadqc.buildFastQCSummaryStatus en Python

Ejemplo n.º 1

Archivo: pipeline_readqc.py Proyecto: CGATOxford/CGATPipelines

def buildFastQCSummaryStatus(infiles, outfile):
    '''load fastqc status summaries into a single table.'''
    exportdir = os.path.join(PARAMS["exportdir"], "fastqc")
    PipelineReadqc.buildFastQCSummaryStatus(infiles, outfile, exportdir)

Ejemplo n.º 2

Archivo: pipeline_readqc.py Proyecto: dormeight/CGATPipelines

def buildFastQCSummaryStatus(infiles, outfile):
    '''load fastqc status summaries into a single table.'''
    exportdir = os.path.join(PARAMS["exportdir"], "fastqc")
    PipelineReadqc.buildFastQCSummaryStatus(infiles, outfile, exportdir)

Ejemplo n.º 3

def buildFastQCSummaryStatus(infiles, outfile):
    '''load FastQC status summaries into a single table.'''
    PipelineReadqc.buildFastQCSummaryStatus(infiles, outfile, "fastqc.dir")