Ejemplos de assert_timestep_almost_equal en Python

Ejemplo n.º 1

Archivo: test_xdr.py Proyecto: kaplajon/mdanalysis

 def test_sub_coordinates(self):
     """
     load solvated trajectory into universe with unsolvated protein.
     """
     self.udry.load_new(self.XDR_SUB_SOL, sub=self.sub)
     ts = self.udry.atoms.ts
     assert_timestep_almost_equal(ts, self.ts)

Ejemplo n.º 2

Archivo: test_xdr.py Proyecto: BartBruininks/mdanalysis

 def test_sub_coordinates(self):
     """
     load solvated trajectory into universe with unsolvated protein.
     """
     self.udry.load_new(self.XDR_SUB_SOL, sub=self.sub)
     ts = self.udry.atoms.ts
     assert_timestep_almost_equal(ts, self.ts)

Ejemplo n.º 3

Archivo: test_xdr.py Proyecto: zouyel/mdanalysis

 def test_sub_coordinates(self, atoms):
     """
     load solvated trajectory into universe with unsolvated protein.
     """
     udry = mda.Universe(PDB_sub_dry)
     udry.load_new(self.XDR_SUB_SOL, sub=atoms.indices)
     ts = udry.atoms.ts
     assert_timestep_almost_equal(ts, atoms.ts)

Ejemplo n.º 4

Archivo: test_xdr.py Proyecto: MDAnalysis/mdanalysis

 def test_sub_coordinates(self, atoms):
     """
     load solvated trajectory into universe with unsolvated protein.
     """
     udry = mda.Universe(PDB_sub_dry)
     udry.load_new(self.XDR_SUB_SOL, sub=atoms.indices)
     ts = udry.atoms.ts
     assert_timestep_almost_equal(ts, atoms.ts)