Ejemplos de getOptions en Python

Ejemplo n.º 1

Archivo: NGSPipeline.py Proyecto: bjpop/ngs-pipeline

def main():
    options = getOptions()
    outputDir = options['dir']
    mkOutputDir(outputDir)
    initLogger(options['logging'])
    control = options['control']
    if control == 'sequential':
        sequential(options)
    elif control == 'parallel':
        parallel(options)

Ejemplo n.º 2

Archivo: NGSPipeline.py Proyecto: boratonAJ/ngs-pipeline

def main():
    options = getOptions()
    outputDir = options['dir']
    mkOutputDir(outputDir)
    initLogger(options['logging'])
    control = options['control']
    if control == 'sequential':
        sequential(options)
    elif control == 'parallel':
        parallel(options)

Ejemplo n.º 3

Archivo: ReferenceDatabase.py Proyecto: bjpop/ngs-pipeline

def main():
    options = getOptions()
    initLogger(options['logging'])
    referenceDatabase(options)

Ejemplo n.º 4

Archivo: ReferenceDatabase.py Proyecto: boratonAJ/ngs-pipeline

def main():
    options = getOptions()
    initLogger(options['logging'])
    referenceDatabase(options)