Ejemplo n.º 1
0
def test_get_freebayes_vaf_method():
    with pysam.VariantFile(fb_vcf) as vcf:
        result = get_vaf_method(vcf)
        assert_equal(result, _get_freebayes_vaf)
Ejemplo n.º 2
0
def test_get_strelka_vaf_method():
    with pysam.VariantFile(strelka_vcf) as vcf:
        result = get_vaf_method(vcf)
        assert_equal(result, _get_strelka_vaf)
Ejemplo n.º 3
0
def test_get_nv_vaf_method():
    with pysam.VariantFile(nv_vcf) as vcf:
        result = get_vaf_method(vcf)
        assert_equal(result, _get_platypus_vaf)