Ejemplos de _intersects_with_annotaton en Python

Ejemplo n.º 1

Archivo: test_xlsites.py Proyecto: ulelab/iCount-Mini

 def test_neg_strand(self):
     segmentation = {
         'gene_id_002': {
             'tr_id_0003': [
                 mock.MagicMock(stop=100),
             ]
         },
     }
     self.assertTrue(
         xlsites._intersects_with_annotaton(100, segmentation, 2, '-'))
     self.assertFalse(
         xlsites._intersects_with_annotaton(101, segmentation, 2, '-'))

Ejemplo n.º 2

Archivo: test_xlsites.py Proyecto: ulelab/iCount-Mini

 def test_pos_strand(self):
     segmentation = {
         'gene_id_001': {
             'tr_id_0001': [
                 mock.MagicMock(start=100),
             ],
             'gene_segment': [],
         }
     }
     self.assertTrue(
         xlsites._intersects_with_annotaton(100, segmentation, 1, '+'))
     self.assertFalse(
         xlsites._intersects_with_annotaton(101, segmentation, 1, '+'))

Ejemplo n.º 3

 def test_neg_strand(self):
     self.assertTrue(
         xlsites._intersects_with_annotaton(100, self.annotation, 2, '-'))
     self.assertFalse(
         xlsites._intersects_with_annotaton(101, self.annotation, 2, '-'))