Ejemplos de EnsemblRelease.gene_id_of_protein_id en Python

Ejemplo n.º 1

Archivo: stringdb.py Proyecto: huayu-zhang/gp-bench

    def mapping_id(self):

        esb = EnsemblRelease(77)
        self.data_filtered['ensembl_id_1'] = [
            esb.gene_id_of_protein_id(protein)
            for protein in self.data_filtered.protein1
        ]
        self.data_filtered['ensembl_id_2'] = [
            esb.gene_id_of_protein_id(protein)
            for protein in self.data_filtered.protein2
        ]