Ejemplos de RdpTaxonAssigner._generate_training_files en Python

Ejemplo n.º 1

Archivo: test_assign_taxonomy.py Proyecto: carze/clovr-base

    def test_generate_training_files(self):
        app = RdpTaxonAssigner({
                'id_to_taxonomy_fp': self.id_to_taxonomy_file.name,
                'reference_sequences_fp': self.reference_seqs_file.name,
                })
        actual_taxonomy_file, actual_training_seqs_file = \
            app._generate_training_files()

        # see note in test_build_tree()
        self.assertEqual(actual_taxonomy_file.read(), rdp_expected_taxonomy)

Ejemplo n.º 2

Archivo: test_assign_taxonomy.py Proyecto: carze/clovr-base

    def test_generate_training_files(self):
        app = RdpTaxonAssigner({
            'id_to_taxonomy_fp':
            self.id_to_taxonomy_file.name,
            'reference_sequences_fp':
            self.reference_seqs_file.name,
        })
        actual_taxonomy_file, actual_training_seqs_file = \
            app._generate_training_files()

        # see note in test_build_tree()
        self.assertEqual(actual_taxonomy_file.read(), rdp_expected_taxonomy)