Ejemplos de RdpTaxonAssigner._generate_training_seqs en Python

Ejemplo n.º 1

Archivo: test_assign_taxonomy.py Proyecto: carze/clovr-base

 def test_generate_training_seqs(self):
     seqs = RdpTaxonAssigner._generate_training_seqs(
         self.reference_seqs_file, self.id_to_taxonomy_file)
     actual = LoadSeqs(data=seqs, aligned=False).toFasta()
     self.assertEqual(actual, rdp_expected_training_seqs)

Ejemplo n.º 2

Archivo: test_assign_taxonomy.py Proyecto: carze/clovr-base

 def test_generate_training_seqs(self):
     seqs = RdpTaxonAssigner._generate_training_seqs(
         self.reference_seqs_file, self.id_to_taxonomy_file)
     actual = LoadSeqs(data=seqs, aligned=False).toFasta()
     self.assertEqual(actual, rdp_expected_training_seqs)