Ejemplos de aa_seq en Python

Ejemplo n.º 1

Archivo: test_selection_pipeline.py Proyecto: BioinformaticsArchive/selectionTools

 def test_aa_seq_header_regex(self):
     options = Args()
     options.ancestralfasta = get_file('ancestor.fa') 
     options.header = 'ANCESTOR_?_FA'
     options.chromosome = '2'
     options.single_chromosome = False
     aaSeq = aa_seq(options)
     self.__verify_sequence__(aaSeq)

Ejemplo n.º 2

Archivo: test_selection_pipeline.py Proyecto: youfeiyu2/selectionTools

 def test_aa_seq_header_regex(self):
     options = Args()
     options.ancestralfasta = get_file('ancestor.fa')
     options.header = 'ANCESTOR_?_FA'
     options.chromosome = '2'
     options.single_chromosome = False
     aaSeq = aa_seq(options)
     self.__verify_sequence__(aaSeq)

Ejemplo n.º 3

Archivo: test_selection_pipeline.py Proyecto: youfeiyu2/selectionTools

 def test_aa_seq_single_chromosome(self):
     options = Args()
     options.ancestralfasta = get_file('ancestor.fa')
     options.single_chromosome = True
     aaSeq = aa_seq(options)
     self.__verify_sequence__(aaSeq)

Ejemplo n.º 4

Archivo: test_selection_pipeline.py Proyecto: BioinformaticsArchive/selectionTools

 def test_aa_seq_single_chromosome(self):
     options = Args()
     options.ancestralfasta = get_file('ancestor.fa')
     options.single_chromosome = True
     aaSeq = aa_seq(options)
     self.__verify_sequence__(aaSeq)