Ejemplos de parse_args en Python

Ejemplo n.º 1

def main():
    args = parse_args()

    with VarScan(args.input_uri, args.output_uri) as smart_tool:
        smart_tool.base_commands = BASE_COMMANDS
        smart_tool.outputs = OUTPUTS
        smart_tool(args.identifier)

Ejemplo n.º 2

def main():
    args = parse_args()

    with StringtieAssembleTranscripts(args.input_uri,
                                      args.output_uri) as smart_tool:
        smart_tool.base_commands = BASE_COMMANDS
        smart_tool.outputs = OUTPUTS
        smart_tool(args.identifier)

Ejemplo n.º 3

Archivo: smarttool_runner.py Proyecto: jic-dtool/smarttools

def main():
    args = parse_args()

    with FastQC(args.input_uri, args.output_uri) as smart_tool:
        smart_tool.base_commands = BASE_COMMANDS
        smart_tool(args.identifier)