Ejemplos de SnakeBidsApp.run_snakemake en Python

Ejemplo n.º 1

Archivo: cli.py Proyecto: akhanf/cookiecutter-snakebids

def main():
    """Console script for {{cookiecutter.project_slug}}."""
    app = SnakeBidsApp(os.path.abspath(os.path.dirname(__file__)))
    app.run_snakemake()
    return 0

Ejemplo n.º 2

Archivo: cli.py Proyecto: akhanf/snakebids2dicom

def main():
    """Console script for snakebids2dicom."""
    app = SnakeBidsApp(os.path.abspath(os.path.dirname(__file__)))
    app.run_snakemake()
    return 0

Ejemplo n.º 3

def main():

    app = SnakeBidsApp(os.path.abspath(os.path.dirname(__file__)))
    app.run_snakemake()

Ejemplo n.º 4

Archivo: run.py Proyecto: akhanf/snakedwi

def main():
    app = SnakeBidsApp(
        os.path.abspath(os.path.dirname(__file__)),
        configfile_path="config/snakebids.yml",
    )
    app.run_snakemake()

Ejemplo n.º 5

def main():
    app = SnakeBidsApp(
        Path(__file__).resolve().parents[1])  # to get repository root
    app.run_snakemake()