Ejemplo n.º 1
0
 def test_empty_strands(self):
     self.assertEqual(hamming.distance("", ""), 0)
Ejemplo n.º 2
0
 def test_single_letter_identical_strands(self):
     self.assertEqual(hamming.distance("A", "A"), 0)
Ejemplo n.º 3
0
 def test_disallow_second_strand_longer(self):
     with self.assertRaisesWithMessage(ValueError):
         hamming.distance("ATA", "AGTG")
Ejemplo n.º 4
0
 def test_disallow_right_empty_strand(self):
     with self.assertRaisesWithMessage(ValueError):
         hamming.distance("G", "")
Ejemplo n.º 5
0
 def test_long_different_strands(self):
     self.assertEqual(hamming.distance("GGACGGATTCTG", "AGGACGGATTCT"), 9)
Ejemplo n.º 6
0
 def test_disallow_first_strand_longer(self):
     with self.assertRaisesWithMessage(ValueError):
         hamming.distance("AATG", "AAA")
Ejemplo n.º 7
0
 def test_single_letter_different_strands(self):
     self.assertEqual(hamming.distance("G", "T"), 1)
Ejemplo n.º 8
0
 def test_long_identical_strands(self):
     self.assertEqual(hamming.distance("GGACTGAAATCTG", "GGACTGAAATCTG"), 0)
Ejemplo n.º 9
0
 def test_hamming_distance_in_very_long_strand(self):
     self.assertEqual(9, distance('GGACGGATTCTG', 'AGGACGGATTCT'))
Ejemplo n.º 10
0
 def test_no_difference_between_identical_strands(self):
     self.assertEqual(0, distance('A', 'A'))
Ejemplo n.º 11
0
 def test_large_hamming_distance(self):
     self.assertEqual(4, distance('GATACA', 'GCATAA'))
Ejemplo n.º 12
0
 def test_small_hamming_distance_in_longer_strand(self):
     self.assertEqual(1, distance('GGACG', 'GGTCG'))
Ejemplo n.º 13
0
 def test_small_hamming_distance(self):
     self.assertEqual(1, distance('AT', 'CT'))
Ejemplo n.º 14
0
 def test_complete_hamming_distance_of_for_small_strand(self):
     self.assertEqual(2, distance('AG', 'CT'))
Ejemplo n.º 15
0
 def test_complete_hamming_distance_of_for_single_nucleotide_strand(self):
     self.assertEqual(1, distance('A', 'G'))