Ejemplos de Transfrag.iterintrons en Python

Ejemplo n.º 1

Archivo: test_transfrag.py Proyecto: tacorna/taco

def test_introns():
    t = Transfrag(chrom='chrTest', strand=Strand.POS,
                  exons=[Exon(0, 10), Exon(20, 30), Exon(40, 50)])
    introns = list(t.iterintrons())
    assert len(introns) == 2
    assert introns[0] == (10, 20)
    assert introns[1] == (30, 40)

Ejemplo n.º 2

Archivo: test_transfrag.py Proyecto: jchenpku/taco

def test_introns():
    t = Transfrag(chrom='chrTest',
                  strand=Strand.POS,
                  exons=[Exon(0, 10), Exon(20, 30),
                         Exon(40, 50)])
    introns = list(t.iterintrons())
    assert len(introns) == 2
    assert introns[0] == (10, 20)
    assert introns[1] == (30, 40)