Ejemplos de Transfrag.itersplices en Python

Ejemplo n.º 1

Archivo: test_transfrag.py Proyecto: jchenpku/taco

def test_splices():
    t = Transfrag(chrom='chrTest',
                  strand=Strand.POS,
                  exons=[Exon(0, 10), Exon(20, 30),
                         Exon(40, 50)])
    splice_sites = frozenset(t.itersplices())
    assert len(splice_sites) == 4
    assert splice_sites == frozenset((10, 20, 30, 40))

Ejemplo n.º 2

Archivo: test_transfrag.py Proyecto: tacorna/taco

def test_splices():
    t = Transfrag(chrom='chrTest', strand=Strand.POS,
                  exons=[Exon(0, 10), Exon(20, 30), Exon(40, 50)])
    splice_sites = frozenset(t.itersplices())
    assert len(splice_sites) == 4
    assert splice_sites == frozenset((10, 20, 30, 40))