Ejemplos de FastaRecord.create en Python

Ejemplo n.º 1

Archivo: unit_tests.py Proyecto: guochangjiang/tinyfasta

    def test_create_fasta_record(self):
        from tinyfasta import FastaRecord
        description = ">seq101|testing"
        sequence = "ATCG"*30
        fasta_record = FastaRecord.create(description, sequence)
        self.assertEqual(str(fasta_record),
""">seq101|testing
ATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCG
ATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCG""")

Ejemplo n.º 2

Archivo: unit_tests.py Proyecto: tjelvar-olsson/tinyfasta

    def test_create_fasta_record(self):
        from tinyfasta import FastaRecord
        description = ">seq101|testing"
        sequence = "ATCG" * 30
        fasta_record = FastaRecord.create(description, sequence)
        self.assertEqual(
            str(fasta_record), """>seq101|testing
ATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCG
ATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCG""")