Ejemplos de peptide_mutation_interval en Python

Ejemplo n.º 1

Archivo: test_peptide_mutation_interval.py Proyecto: Saintyven/topiary

def test_peptide_mutation_interval_no_overlap_after():
    with assert_raises(ValueError):
        peptide_mutation_interval(
            peptide_start_in_protein=10,
            peptide_length=9,
            mutation_start_in_protein=25,
            mutation_end_in_protein=26)

Ejemplo n.º 2

Archivo: test_peptide_mutation_interval.py Proyecto: xflicsu/topiary

def test_peptide_mutation_interval_deletion():
    start, end = peptide_mutation_interval(peptide_start_in_protein=10,
                                           peptide_length=9,
                                           mutation_start_in_protein=15,
                                           mutation_end_in_protein=15)
    eq_(start, 5)
    eq_(end, 5)

Ejemplo n.º 3

Archivo: test_peptide_mutation_interval.py Proyecto: xflicsu/topiary

def test_peptide_mutation_interval_middle():
    start, end = peptide_mutation_interval(peptide_start_in_protein=10,
                                           peptide_length=9,
                                           mutation_start_in_protein=11,
                                           mutation_end_in_protein=12)
    eq_(start, 1)
    eq_(end, 2)

Ejemplo n.º 4

Archivo: test_peptide_mutation_interval.py Proyecto: xflicsu/topiary

def test_peptide_mutation_interval_end():
    start, end = peptide_mutation_interval(peptide_start_in_protein=10,
                                           peptide_length=9,
                                           mutation_start_in_protein=18,
                                           mutation_end_in_protein=20)
    eq_(start, 8)
    eq_(end, 9)