Ejemplos de is_indexed en Python

Ejemplo n.º 1

Archivo: test_umitools.py Proyecto: brwnj/umitools

def test_indexed_sorted_bam():
    bam = os.path.join(DATA, "ordered_umi.bam")
    bai = os.path.join(DATA, "ordered_umi.bam.bai")
    if os.path.exists(bai):
        os.remove(bai)
    is_indexed(bam)
    assert os.path.exists(bai)
    os.remove(bai)

Ejemplo n.º 2

def test_indexed_sorted_bam():
    bam = os.path.join(DATA, "ordered_umi.bam")
    bai = os.path.join(DATA, "ordered_umi.bam.bai")
    if os.path.exists(bai):
        os.remove(bai)
    is_indexed(bam)
    assert os.path.exists(bai)
    os.remove(bai)

Ejemplo n.º 3

Archivo: test_umitools.py Proyecto: brwnj/umitools

def test_indexed_unsorted_bam():
    bam = os.path.join(DATA, "unsorted.bam")
    is_indexed(bam)

Ejemplo n.º 4

def test_indexed_unsorted_bam():
    bam = os.path.join(DATA, "unsorted.bam")
    is_indexed(bam)