コード例 #1
0
ファイル: test_umitools.py プロジェクト: brwnj/umitools 
def test_indexed_sorted_bam():
    bam = os.path.join(DATA, "ordered_umi.bam")
    bai = os.path.join(DATA, "ordered_umi.bam.bai")
    if os.path.exists(bai):
        os.remove(bai)
    is_indexed(bam)
    assert os.path.exists(bai)
    os.remove(bai)
コード例 #2
0
def test_indexed_sorted_bam():
    bam = os.path.join(DATA, "ordered_umi.bam")
    bai = os.path.join(DATA, "ordered_umi.bam.bai")
    if os.path.exists(bai):
        os.remove(bai)
    is_indexed(bam)
    assert os.path.exists(bai)
    os.remove(bai)
コード例 #3
0
ファイル: test_umitools.py プロジェクト: brwnj/umitools 
def test_indexed_unsorted_bam():
    bam = os.path.join(DATA, "unsorted.bam")
    is_indexed(bam)
コード例 #4
0
def test_indexed_unsorted_bam():
    bam = os.path.join(DATA, "unsorted.bam")
    is_indexed(bam)