def test_MedicAlgorithmLesionToads_outputs():
output_map = dict(outCortical=dict(),
outFilled=dict(),
outHard=dict(),
outHard2=dict(),
outInhomogeneity=dict(),
outLesion=dict(),
outMembership=dict(),
outSulcal=dict(),
outWM=dict(),
)
outputs = MedicAlgorithmLesionToads.output_spec()
for key, metadata in output_map.items():
for metakey, value in metadata.items():
yield assert_equal, getattr(outputs.traits()[key], metakey), value
def test_MedicAlgorithmLesionToads_inputs():
input_map = dict(args=dict(argstr='%s',
),
environ=dict(nohash=True,
usedefault=True,
),
ignore_exception=dict(nohash=True,
usedefault=True,
),
inAtlas=dict(argstr='--inAtlas %s',
),
inAtlas2=dict(argstr='--inAtlas2 %s',
),
inAtlas3=dict(argstr='--inAtlas3 %s',
),
inAtlas4=dict(argstr='--inAtlas4 %s',
),
inAtlas5=dict(argstr='--inAtlas5 %f',
),
inAtlas6=dict(argstr='--inAtlas6 %s',
),
inConnectivity=dict(argstr='--inConnectivity %s',
),
inCorrect=dict(argstr='--inCorrect %s',
),
inFLAIR=dict(argstr='--inFLAIR %s',
),
inInclude=dict(argstr='--inInclude %s',
),
inMaximum=dict(argstr='--inMaximum %d',
),
inMaximum2=dict(argstr='--inMaximum2 %d',
),
inMaximum3=dict(argstr='--inMaximum3 %d',
),
inMaximum4=dict(argstr='--inMaximum4 %f',
),
inMaximum5=dict(argstr='--inMaximum5 %d',
),
inOutput=dict(argstr='--inOutput %s',
),
inOutput2=dict(argstr='--inOutput2 %s',
),
inOutput3=dict(argstr='--inOutput3 %s',
),
inSmooting=dict(argstr='--inSmooting %f',
),
inT1_MPRAGE=dict(argstr='--inT1_MPRAGE %s',
),
inT1_SPGR=dict(argstr='--inT1_SPGR %s',
),
null=dict(argstr='--null %s',
),
outCortical=dict(argstr='--outCortical %s',
hash_files=False,
),
outFilled=dict(argstr='--outFilled %s',
hash_files=False,
),
outHard=dict(argstr='--outHard %s',
hash_files=False,
),
outHard2=dict(argstr='--outHard2 %s',
hash_files=False,
),
outInhomogeneity=dict(argstr='--outInhomogeneity %s',
hash_files=False,
),
outLesion=dict(argstr='--outLesion %s',
hash_files=False,
),
outMembership=dict(argstr='--outMembership %s',
hash_files=False,
),
outSulcal=dict(argstr='--outSulcal %s',
hash_files=False,
),
outWM=dict(argstr='--outWM %s',
hash_files=False,
),
terminal_output=dict(mandatory=True,
nohash=True,
),
xDefaultMem=dict(argstr='-xDefaultMem %d',
),
xMaxProcess=dict(argstr='-xMaxProcess %d',
usedefault=True,
),
xPrefExt=dict(argstr='--xPrefExt %s',
),
)
inputs = MedicAlgorithmLesionToads.input_spec()
for key, metadata in input_map.items():
for metakey, value in metadata.items():
yield assert_equal, getattr(inputs.traits()[key], metakey), value