Esempi in Python per sequence_complexity

Esempio n. 1

File: test_bam.py Progetto: shenjia1/mavis

 def test_empty(self):
     self.assertEqual(0, _read.sequence_complexity(''))

Esempio n. 2

 def test_empty(self):
     assert _read.sequence_complexity('') == 0

Esempio n. 3

File: test_bam.py Progetto: shenjia1/mavis

 def test_low_at(self):
     seq = 'TATATATAAATATATATTTATATATACATTATTTATATATAAATATATATTTATACATTATTTATATATAAATATATATTTATATATACATTATGTATATATAAAT'
     self.assertEqual(0.04, round(_read.sequence_complexity(seq), 2))

Esempio n. 4

 def test_low_at(self):
     seq = 'TATATATAAATATATATTTATATATACATTATTTATATATAAATATATATTTATACATTATTTATATATAAATATATATTTATATATACATTATGTATATATAAAT'
     assert round(_read.sequence_complexity(seq), 2) == 0.04