コード例 #1
0
ファイル: test_bam.py プロジェクト: shenjia1/mavis 
 def test_empty(self):
     self.assertEqual(0, _read.sequence_complexity(''))
コード例 #2
0
 def test_empty(self):
     assert _read.sequence_complexity('') == 0
コード例 #3
0
ファイル: test_bam.py プロジェクト: shenjia1/mavis 
 def test_low_at(self):
     seq = 'TATATATAAATATATATTTATATATACATTATTTATATATAAATATATATTTATACATTATTTATATATAAATATATATTTATATATACATTATGTATATATAAAT'
     self.assertEqual(0.04, round(_read.sequence_complexity(seq), 2))
コード例 #4
0
 def test_low_at(self):
     seq = 'TATATATAAATATATATTTATATATACATTATTTATATATAAATATATATTTATACATTATTTATATATAAATATATATTTATATATACATTATGTATATATAAAT'
     assert round(_read.sequence_complexity(seq), 2) == 0.04