def test_EpiReg_inputs():
input_map = dict(args=dict(argstr='%s',
),
echospacing=dict(argstr='--echospacing=%f',
),
environ=dict(nohash=True,
usedefault=True,
),
epi=dict(argstr='--epi=%s',
mandatory=True,
position=-4,
),
fmap=dict(argstr='--fmap=%s',
),
fmapmag=dict(argstr='--fmapmag=%s',
),
fmapmagbrain=dict(argstr='--fmapmagbrain=%s',
),
ignore_exception=dict(nohash=True,
usedefault=True,
),
no_clean=dict(argstr='--noclean',
),
no_fmapreg=dict(argstr='--nofmapreg',
),
out_base=dict(argstr='--out=%s',
position=-1,
usedefault=True,
),
output_type=dict(),
pedir=dict(argstr='--pedir=%s',
),
t1_brain=dict(argstr='--t1brain=%s',
mandatory=True,
position=-2,
),
t1_head=dict(argstr='--t1=%s',
mandatory=True,
position=-3,
),
terminal_output=dict(nohash=True,
),
weight_image=dict(argstr='--weight=%s',
),
wmseg=dict(argstr='--wmseg=%s',
),
)
inputs = EpiReg.input_spec()
for key, metadata in input_map.items():
for metakey, value in metadata.items():
yield assert_equal, getattr(inputs.traits()[key], metakey), value
def test_EpiReg_inputs():
input_map = dict(
args=dict(argstr='%s', ),
echospacing=dict(argstr='--echospacing=%f', ),
environ=dict(
nohash=True,
usedefault=True,
),
epi=dict(
argstr='--epi=%s',
mandatory=True,
position=-4,
),
fmap=dict(argstr='--fmap=%s', ),
fmapmag=dict(argstr='--fmapmag=%s', ),
fmapmagbrain=dict(argstr='--fmapmagbrain=%s', ),
ignore_exception=dict(
nohash=True,
usedefault=True,
),
no_clean=dict(argstr='--noclean', ),
no_fmapreg=dict(argstr='--nofmapreg', ),
out_base=dict(
argstr='--out=%s',
position=-1,
),
output_type=dict(),
pedir=dict(argstr='--pedir=%s', ),
t1_brain=dict(
argstr='--t1brain=%s',
mandatory=True,
position=-2,
),
t1_head=dict(
argstr='--t1=%s',
mandatory=True,
position=-3,
),
terminal_output=dict(
mandatory=True,
nohash=True,
),
weight_image=dict(argstr='--weight=%s', ),
wmseg=dict(argstr='--wmseg=%s', ),
)
inputs = EpiReg.input_spec()
for key, metadata in input_map.items():
for metakey, value in metadata.items():
yield assert_equal, getattr(inputs.traits()[key], metakey), value
def test_EpiReg_outputs():
output_map = dict(epi2str_inv=dict(),
epi2str_mat=dict(),
fmap2epi_mat=dict(),
fmap2str_mat=dict(),
fmap_epi=dict(),
fmap_str=dict(),
fmapmag_str=dict(),
fullwarp=dict(),
out_1vol=dict(),
out_file=dict(),
shiftmap=dict(),
wmedge=dict(),
wmseg=dict(),
)
outputs = EpiReg.output_spec()
for key, metadata in output_map.items():
for metakey, value in metadata.items():
yield assert_equal, getattr(outputs.traits()[key], metakey), value
def test_EpiReg_outputs():
output_map = dict(
epi2str_inv=dict(),
epi2str_mat=dict(),
fmap2epi_mat=dict(),
fmap2str_mat=dict(),
fmap_epi=dict(),
fmap_str=dict(),
fmapmag_str=dict(),
fullwarp=dict(),
out_1vol=dict(),
out_file=dict(),
shiftmap=dict(),
wmedge=dict(),
wmseg=dict(),
)
outputs = EpiReg.output_spec()
for key, metadata in output_map.items():
for metakey, value in metadata.items():
yield assert_equal, getattr(outputs.traits()[key], metakey), value
