コード例 #1
0
ファイル: test_blast.py プロジェクト: Rory-McLeod/ENZA_Pc
 def test_interpertBlast(self):
     tempBlast = Blast("", "")
     tempBlast.makeDatabase("test_data/reference.fasta")
     tempBlast.aliasTool("test_data/reference.fasta", "test_data")
     tempBlast.query = "test_data/contigs_1.fasta"
     tempBlast.doBlast("test_data")
     tempBlast.interpertBlast("test_data")
     self.assertEqual(len(tempBlast.hitSet), 3)