def test_interpertBlast(self): tempBlast = Blast("", "") tempBlast.makeDatabase("test_data/reference.fasta") tempBlast.aliasTool("test_data/reference.fasta", "test_data") tempBlast.query = "test_data/contigs_1.fasta" tempBlast.doBlast("test_data") tempBlast.interpertBlast("test_data") self.assertEqual(len(tempBlast.hitSet), 3)