コード例 #1
0
ファイル: test_util.py プロジェクト: souravsingh/mdanalysis
    def test_blocks_of_3(self):
        # testing non square array
        arr = np.arange(32).reshape(8, 4)

        view = util.blocks_of(arr, 2, 1)

        assert view.shape == (4, 2, 1)
コード例 #2
0
ファイル: test_util.py プロジェクト: BartBruininks/mdanalysis
    def test_blocks_of_3(self):
        # testing non square array
        arr = np.arange(32).reshape(8, 4)

        view = util.blocks_of(arr, 2, 1)

        assert_(view.shape == (4, 2, 1))
コード例 #3
0
ファイル: test_util.py プロジェクト: souravsingh/mdanalysis
    def test_blocks_of_2(self):
        arr = np.arange(16).reshape(4, 4)

        view = util.blocks_of(arr, 2, 2)

        # should return (2, 2, 2)
        assert view.shape == (2, 2, 2)
        assert_array_almost_equal(
            view, np.array([[[0, 1], [4, 5]], [[10, 11], [14, 15]]]))

        view[0] = 100
        view[1] = 200

        assert_array_almost_equal(
            arr,
            np.array([[100, 100, 2, 3], [100, 100, 6, 7], [8, 9, 200, 200],
                      [12, 13, 200, 200]]))
コード例 #4
0
ファイル: test_util.py プロジェクト: souravsingh/mdanalysis
    def test_blocks_of_1(self):
        arr = np.arange(16).reshape(4, 4)

        view = util.blocks_of(arr, 1, 1)

        # should return a (4, 1, 1) view
        # ie 4 lots of 1x1
        assert view.shape == (4, 1, 1)
        assert_array_almost_equal(view, np.array([[[0]], [[5]], [[10]],
                                                  [[15]]]))

        # Change my view, check changes are reflected in arr
        view[:] = 1001

        assert_array_almost_equal(
            arr,
            np.array([[1001, 1, 2, 3], [4, 1001, 6, 7], [8, 9, 1001, 11],
                      [12, 13, 14, 1001]]))
コード例 #5
0
ファイル: test_util.py プロジェクト: BartBruininks/mdanalysis
    def test_blocks_of_2(self):
        arr = np.arange(16).reshape(4, 4)

        view = util.blocks_of(arr, 2, 2)

        # should return (2, 2, 2)
        assert_(view.shape == (2, 2, 2))
        assert_array_almost_equal(view, np.array([[[0, 1], [4, 5]],
                                                  [[10, 11], [14, 15]]]))

        view[0] = 100
        view[1] = 200

        assert_array_almost_equal(arr,
                                  np.array([[100, 100, 2, 3],
                                            [100, 100, 6, 7],
                                            [8, 9, 200, 200],
                                            [12, 13, 200, 200]]))
コード例 #6
0
ファイル: test_util.py プロジェクト: BartBruininks/mdanalysis
    def test_blocks_of_1(self):
        arr = np.arange(16).reshape(4, 4)

        view = util.blocks_of(arr, 1, 1)

        # should return a (4, 1, 1) view
        # ie 4 lots of 1x1
        assert_(view.shape == (4, 1, 1))
        assert_array_almost_equal(view, np.array([[[0]], [[5]], [[10]], [[15]]]))

        # Change my view, check changes are reflected in arr
        view[:] = 1001

        assert_array_almost_equal(arr,
                                  np.array([[1001, 1, 2, 3],
                                            [4, 1001, 6, 7],
                                            [8, 9, 1001, 11],
                                            [12, 13, 14, 1001]]))
コード例 #7
0
ファイル: test_util.py プロジェクト: souravsingh/mdanalysis
 def test_blocks_of_ValueError(self):
     arr = np.arange(16).reshape(4, 4)
     with pytest.raises(ValueError):
         util.blocks_of(arr, 2, 1)